米Apple Computerが米国時間2月7日に,BLAST用検索ソフトウエア「Apple/Genentech BLAST」を発表した。BLASTとは,DNAまたはタンパク質の配列の類似性を検索できるデータベースのことで,バイオメディカル(生物医学)研究や薬品開発に利用されている。
Apple社によると,「Apple/Genentech BLASTの性能は,同社のデスクトップ・パソコン『デュアル1GHz Power Mac G4』を用いて一般的な検索を行った場合,動作周波数2GHzの米Intel製『Pentium 4』を搭載したシステムで米国立バイオテクノロジー情報センター(NCBI:National Center for Biotechnology Information)の検索プログラム『NCBI-BLAST』を動作させるよりも5倍以上高速」(Apple社)という。
Apple/Genentech BLASTはApple社のAdvanced Computation Group(ACG)部門と米Genentech,スタンフォード大学遺伝学部が共同で開発した。
「Apple/Genentech BLASTを使うことで,研究者は基礎的なバイオメディカル研究や薬品開発で遺伝子情報をより効率的に利用できる」(Genentech社研究部門上級バイス・プレジデントのRichard H. Scheller氏)
Apple社はApple/Genentech BLASTをオープン・ソース・ソフトウエアとして提供する。NCBIと協力し,バイオメディカル・コミュニティがApple/Genentech BLASTのコードを容易に利用できるようにする。Apple/Genentech BLASTのコードおよび性能解析の情報はWWWサイトから入手できる。
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