（1）非同期機能の強化で目立つのは，Javaプログラムから，Javaおよび非Javaプログラムに対して非同期にメッセージを交換するためのインタフェース「JMS（Java Message Service）」に関連する部分を強化し，さらに，「WS-ReliableMessaging」という規格を実装したこと。JMSのパフォーマンスは5～6倍向上し，メッセージの配信順序を保証する機能やフェールオーバーの機能などが搭載される。「WS-ReliableMessaging」とは，高信頼メッセージング機能に関する次世代Webサービスの規格の一つである。これにより，「ロング・トランザクションであるビジネス・プロセスをシステムで実装しやすくなる」（伊藤氏）。
（2）の運用管理機能では，アプリケーションのバージョンアップ機能を強化したり，オブジェクト指向のスクリプト言語であるPythonのJava版「Jython」を利用できるようにしたりする。前者は「Live Update機能」と呼び，システム停止やセッションの中断なくアプリケーションのバージョンアップを可能にする。プログラムをバージョンアップするとき，既存のセッションがある場合は古いプログラムに接続し，新しいセッションからバージョンアップ後のプログラムにセッションをつなぐ。従来のホットデプロイ機能では，利用中のセッションが中断する問題が起きていた。後者のJythonは，コンフィギュレーションの変更やオンライン・モニタリングなど運用管理のためのスクリプトを生成する。
BEA WebLogic Server 9.0はJ2EE 1.4に準拠。EJB（Enterprise JavaBeans）3.0は実装していない。また2005年は，BEA WebLogic Server 9.0の製品発表以降，開発ツールのWebLogic Workshop，ESB（Enterprise Service Bus）の新製品QuickSilver（プロジェクト名）を出荷する予定である。
