独立行政法人 産業技術総合研究所は2008年5月26日，ハード・ディスクにインストールせずにCDから起動して使えるLinuxディストリビューション「KNOPPIX5.3.1CD日本語版(LCAT対応)」（以下KNOPPIX5.3.1 CD）をリリースした（写真1）。
KNOPPIX 5.3.1 CDはドイツのKNOPPIXの本家では公開されておらず，産業技術総合研究所が独自にカスタマイズしたもの。同研究所が2008年4月14日に公開した「KNOPPIX 5.3.1DVD日本語版（LCAT対応）」をベースにパッケージを削り，CDメディア（700Mバイト）に格納できるサイズに縮小した。LCAT（Live CD Acceleration Tool kit）を使うことでメディアからの起動時間を高速化した点はDVD日本語版と同じだ。
KNOPPIX5.3.1 CD版では，統合デスクトップ環境の「KDE 3.5.9」や3Dウィンドウマネージャの「Compiz-Fusion 0.7.3」，Firefoxと互換のあるWebブラウザの「iceweasel 2.0.0.12」，Thunderbirdと互換のあるメール・クライアントの「icedove 2.0.0.9」，オフィススイートの「OpenOffice.org 2.3.1」，仮想化環境の「QEMU 0.9.1」などが収録されている。
容量の制限があるため，DVD版に比べ多くのアプリケーションが削除された。例えば，統合デスクトップ環境「KDE 4」や仮想化環境の「VirtualBox OSE」，アクセシビリティの「ADRIANE Audio-Desktop」や「Orca」，Windowsのファイル・システム上にKNOPPIXをインストールする「install2win」などが削除された。
また，DVD日本語版も修正版をリリースした。4月14日に公開したKNOPPIXと比べ，OpenSSLの脆弱性の問題の修正を施している。
修正済みのDVD版では，ネットワーク上に配置されたイメージからOSを起動できる「InetBoot」も搭載した。InetBootは，HTTPを利用してサーバー上に配置されたイメージをダウンロードし，そのイメージを利用してOSの起動が行える。HTTP-FUSE KNOPPIX 5.1.1や同KNOPPIX 5.0.1などを起動可能だ。InetBootを利用して起動する場合はブート画面で「inetboot」を入力する。すると，起動メニューを表示するので，ここから起動したいKNOPPIXを選択すればよい（写真2）。
