2006年10月31日まで口座を開設したユーザーに1000円をプレゼントするキャンペーンを行っている

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　ヤフーは2006年9月20日、「Yahoo!ネットバンキング」を開始した。2006年3月にジャパンネット銀行と資本提携を結んでから初めて具体的なサービスが開始されたことになる。同年11月1日以降はこれを「Yahoo!オークション」と連携させるという。

　Yahoo!ネットバンキングを利用するには、Yahoo!JAPAN IDを取得し、「Yahoo!ウォレット」に登録後、ジャパンネット銀行の普通預金口座を開設する必要がある。Yahoo!ウォレットは「本人確認のため」（ヤフー）であり、すでにジャパンネット銀行で口座を持っているユーザーも必要となる。開始当初提供するのはジャパンネット銀行ですでに提供している預金や口座照会のみ。これらのサービスはリンクという形でジャパンネット銀行のWebページ内で実現される。

　11月1日からは「Yahoo!オークション」と連携した「オークション出納帳」を開始する予定。出品者と落札者が共にYahoo!ネットバンキングを利用していれば、取引がスムーズに行える。本人確認が容易になるので、不正が行われにくくなるという。

　出品者が取引する際には、1回の取引ごとに割り当てられるジャパンネット銀行の「ワンタイム口座」を利用する。出品商品が落札されると、その商品専用の入金口座であるワンタイム口座がジャパンネット銀行に開設される。出品者には商品ごとに代金受け取り状況の一覧が作成され、そこから代金の請求や入金状況の確認ができる。落札者にも落札商品の一覧が作成され、支払いや落札商品ごとの支払い状況が確認できる。

　モバイル版「Yahoo!ネットバンキング」も10月上旬にサービスを開始する予定だという。