産業技術総合研究所は2006年6月23日，CD-ROM/DVD-ROMから起動してインストールすることなく利用できるLinuxディストリビューションの新版「KNOPPIX 5.0.1 CD/DVD日本語版」を公開した（写真1，関連記事）。
2006年4月13日に公開した「KNOPPIX 5.0」のバージョンアップ版に相当する。5.0ではDVD-ROMイメージのみが公開されていたが，5.0.1版では更新されたDVD-ROMイメージと併せてCD-ROMイメージ（knoppix_v5.0.1CD_20060601-20060614+IPAFont_AC20060623.iso）も作成した。CD-ROM版は，2005年9月に公開された4.0版以来の新バージョンとなる。
CD-ROM版，DVD-ROM版ともに，KNOPPIX 5.0と同様，高速化ツールキット「LCAT」を採用し，起動時間を約50秒間短縮できたという（写真2）。
主な変更点は，coLinux，パッケージ，起動画面設定などである。coLinuxは，従来Windows側のXサーバーとしてCygwinを用いていたが，VNCも利用できるようになった。パッケージでは，X Window Systemを実装するX.orgを6.9から，モジュール対応の7.0に更新している。カーネルも2.6.15から2.6.17rc版にアップデートした。Firefoxは1.5.0.1から1.5.0.3に，OpenOffice.orgは2.0.1-5から2.0.2-3になるなど，主要アプリケーションも更新した。注意点として，今回からCD-ROM版にはEmacsを収録していない。これは容量の制限による。
細かな変更では，起動時オプションにCAPSキーとCTRLキーを入れ替えるものが追加されている。
